RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-213ENST00000460211 CCL16O15467 120 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 HUS1O60921 280 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 POU2F2P09086 479 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 AP3M2P53677 418 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 CEP135Q66GS9 1140 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 DMAC2Q9NW81 257 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 CLUHO75153 1309 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PHACTR2O75167 634 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ADCY1Q08828 1119 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SMARCB1Q12824 385 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 GPR17Q13304 367 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TRPC3Q13507 836 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 WSCD1Q658N2 575 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ELMOD1Q8N336 334 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 BORCS6Q96GS4 357 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 HPDLQ96IR7 371 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PRR23AA6NEV1 266 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PROB1E7EW31 1015 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 FSHRP23945 695 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 NUBP1P53384 320 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 UBE2HP62256 183 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 STIM1Q13586 685 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 NFIL3Q16649 462 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 IQCEQ6IPM2 695 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 DPH6Q7L8W6 267 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SPATA18Q8TC71 538 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SIX4Q9UIU6 781 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PTPRJQ12913 1337 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 OR4Q2P0C623 313 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 KRT13P13646 458 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PTPN2P17706 415 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 NR2F2P24468 414 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 LHX1P48742 406 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 MYL7Q01449 175 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TSPY1Q01534 308 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PLD1Q13393 1074 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ADAM9Q13443 819 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 FLCNQ8NFG4 579 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 CXorf38Q8TB03 319 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SPATA20Q8TB22 786 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TMC2Q8TDI7 906 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TSG101Q99816 390 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ANK1P16157 1881 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 MAPK13O15264 365 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SEC24AO95486 1093 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ATICP31939 592 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PPP1R2P41236 205 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 NBL1P41271 181 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ALDH1A3P47895 512 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 EPHB3P54753 998 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 DUSP4Q13115 394 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 BIRC3Q13489 604 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 FAM84AQ96KN4 292 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 MMS19Q96T76 1030 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-213ENST00000460211 SCN1AP35498 2009 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms