RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DLL1O00548 723 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CETN3O15182 167 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TACC1O75410 805 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA31D3P0C874 917 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DLATP10515 647 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GTF2H1P32780 548 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMS1P54277 932 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DLG4P78352 724 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYO1EQ12965 1108 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WSCD1Q658N2 575 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD40Q6AI12 368 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SV2AQ7L0J3 742 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP37Q86T82 979 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDCL2Q8N4E4 241 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF4BQ92750 862 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HPDLQ96IR7 371 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PKMYT1Q99640 499 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACBD6Q9BR61 282 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 L1RE1Q9UN81 338 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PMM2O15305 246 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HUS1O60921 280 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MICAL2O94851 1124 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC24AO95486 1093 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VNN1O95497 513 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C8AP07357 584 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LHX1P48742 406 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VAMP7P51809 220 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPHA5P54756 1037 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIN9Q5TKA1 542 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TTI2Q6NXR4 508 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM171BQ6P995 826 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRTM3Q86VH5 581 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GBP4Q96PP9 640 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLSTN2Q9H4D0 955 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDH22Q9UJ99 828 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COQ4Q9Y3A0 265 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSC2P49815 1807 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PI4K2BG5E9Z4 385 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMA7O14818 248 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASS1P00966 412 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MARSP56192 900 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP3CAQ08209 521 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BFSP1Q12934 665 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STIM1Q13586 685 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 METTL23Q86XA0 190 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM186BQ8IYM0 893 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THEM5Q8N1Q8 247 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC7A14Q8TBB6 771 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP63Q96MT8 703 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APOL5Q9BWW9 433 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NR2E1Q9Y466 385 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNX9Q9Y5X1 595 aa12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOTCH4Q99466 2003 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTMR11A4FU01 709 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XYLBO75191 536 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT19P08727 400 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WEE2P0C1S8 567 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYL6P60660 151 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADCY1Q08828 1119 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCOA4Q13772 614 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPM1LQ5SGD2 360 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP135Q66GS9 1140 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OTOP3Q7RTS5 596 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OSTM1Q86WC4 334 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MLKLQ8NB16 471 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MED15Q96RN5 788 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM209Q96SK2 561 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSG101Q99816 390 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC3Q9BY71 257 aa12.04□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms