RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446449.1

CREB1-208, Transcript of cAMP responsive element binding protein 1, human

TSL 3

Gene CREB1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREB1-208	ENST00000446449	GJB1	P08034	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PBK	Q96KB5	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	KATNA1	O75449	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CHEK2	O96017	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RHO	P08100	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CELA2A	P08217	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	GNAI3	P08754	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	NDUFV1	P49821	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	GNAI1	P63096	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RFK	Q969G6	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SOAT2	O75908	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	NR2F6	P10588	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ODF1	Q14990	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	DDB2	Q92466	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	POLH	Q9Y253	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ARIH2	O95376	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RARB	P10826	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ITGAL	P20701	1170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PRDX5	P30044	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ZNF81	P51508	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	MIER2	Q8N344	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	TNKS	O95271	1327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	VPS4B	O75351	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	ERBB2	P04626	1255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CCND1	P24385	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PHKA1	P46020	1223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	CCT8	P50990	548 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	TFF2	Q03403	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	TCF15	Q12870	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	KIF22	Q14807	665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	TBCC	Q15814	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CREB1-208	ENST00000446449	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms