RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446068.6

ARPP21-222, Transcript of cAMP regulated phosphoprotein 21, human

TSL 5

Gene ARPP21, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARPP21-222	ENST00000446068	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TRIM75P	A6NK02	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TPP1	O14773	563 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	RAP2A	P10114	183 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	AKAP5	P24588	427 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SREBF1	P36956	1147 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	KRT85	P78386	507 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MXRA7	P84157	204 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	BIRC3	Q13489	604 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TRIM14	Q14142	442 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MIER2	Q8N344	545 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TMTC2	Q8N394	836 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TEX19	Q8NA77	164 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GPR156	Q8NFN8	814 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	OR7D4	Q8NG98	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	POF1B	Q8WVV4	589 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TBCB	Q99426	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CGB1	A6NKQ9	187 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	POU2F2	P09086	479 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SLC5A1	P13866	664 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MAN1A1	P33908	653 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ALDH1A3	P47895	512 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	RENBP	P51606	427 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CACNA2D1	P54289	1103 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CYP2A13	Q16696	494 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PCGF5	Q86SE9	256 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SLC9A6	Q92581	669 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	NELL1	Q92832	810 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CCDC138	Q96M89	665 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	APOL5	Q9BWW9	433 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	BCO1	Q9HAY6	547 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PHF2	O75151	1096 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GPANK1	O95872	356 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ZBED1	O96006	694 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	POMC	P01189	267 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ATP5J	P18859	108 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	C5AR1	P21730	350 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ENPP1	P22413	925 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GCSH	P23434	173 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PCSK1	P29120	753 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PER3	P56645	1201 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PROK1	P58294	105 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	NHLH1	Q02575	133 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	PPP3CA	Q08209	521 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ADRM1	Q16186	407 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	GEN1	Q17RS7	908 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARPP21-222	ENST00000446068	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms