RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 SOAT2O75908 522 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 RPN1P04843 607 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PRR29P0C7W0 189 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 NUCB2P80303 420 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 MTSS1LQ765P7 747 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 TTC9BQ8N6N2 239 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA0895Q8NCT3 520 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 FLCNQ8NFG4 579 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 FAM122AQ96E09 287 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 FNBP1Q96RU3 617 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SIX4Q9UIU6 781 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SNX9Q9Y5X1 595 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PQ27 194 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PQ64 194 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PQD8 194 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 HUS1O60921 280 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 TNNI1P19237 187 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 EPHB3P54753 998 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PLD1Q13393 1074 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CENPPQ6IPU0 288 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SIX5Q8N196 739 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC52Q8N7C0 313 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 KXD1Q9BQD3 176 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 RTP3Q9BQQ7 232 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 ASAH2Q9NR71 780 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CA14Q9ULX7 337 aa29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF197O14709 1029 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 EXOC3O60645 756 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PSMD2Q13200 908 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 IER5LQ5T953 404 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 WDR49Q8IV35 697 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 L1RE1Q9UN81 338 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 STK25O00506 426 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 MYL1P05976 194 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SRFP11831 508 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 GJA1P17302 382 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CCR2P41597 374 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CYP24A1Q07973 514 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 MYO1EQ12965 1108 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 MGAT5BQ3V5L5 792 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PRSS36Q5K4E3 855 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CXorf38Q8TB03 319 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF202O95125 648 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 RFX1P22670 979 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 AVPR2P30518 371 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA5Q8TBA6 731 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 GPR152Q8TDT2 470 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 HPDLQ96IR7 371 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 GDE1Q9NZC3 331 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 TSPY1Q01534 308 aa29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 PSMD6Q15008 389 aa29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 LRRTM3Q86VH5 581 aa29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 CGRRF1Q99675 332 aa29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJC25Q9H1X3 360 aa29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 WDFY4Q6ZS81 3184 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 CLSTN1O94985 981 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 PLA2G5P39877 138 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRF2Q8IZF7 708 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 GDAP2Q9NXN4 497 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 KMT2EQ8IZD2 1858 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 GPC5P78333 572 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 MYL7Q01449 175 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 POTEHQ6S545 545 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 C12orf56Q8IXR9 622 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 LEMD2Q8NC56 503 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 WNT16Q9UBV4 365 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 TUFMP49411 452 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 CASP4P49662 377 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 DPYDQ12882 1025 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 TEAD2Q15562 447 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 OSTM1Q86WC4 334 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM86AQ8N2M4 240 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 GIPC2Q8TF65 315 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-210ENST00000440825 MMS19Q96T76 1030 aa29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms