RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 KANSL3Q9P2N6 904 aa15.74■□□□□ 0.11
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TOP3B-206ENST00000436282 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.74■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 UTRNP46939 3433 aa15.74■□□□□ 0.11
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TOP3B-206ENST00000436282 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 UCMAQ8WVF2 138 aa15.73■□□□□ 0.11
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TOP3B-206ENST00000436282 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SLC16A4O15374 487 aa15.73■□□□□ 0.11
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TOP3B-206ENST00000436282 KRT4P19013 534 aa15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 KCNA3P22001 575 aa15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CETN2P41208 172 aa15.73■□□□□ 0.11
TOP3B-206ENST00000436282 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
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