RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SLC1A1P43005 524 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R40P59535 323 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CLUL1Q15846 466 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 NOTUMQ6P988 496 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
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FAAP20-209ENST00000428120 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PASKQ96RG2 1323 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PHF2O75151 1096 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 ATICP31939 592 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
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FAAP20-209ENST00000428120 TTC27Q6P3X3 843 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 ERICH1Q86X53 443 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CEP83Q9Y592 693 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PPEF2O14830 753 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CILPO75339 1184 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CALB1P05937 261 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 AKAP5P24588 427 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SREBF2Q12772 1141 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SNX17Q15036 470 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TERF2Q15554 542 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 IGHA2P01877 340 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 RARAP10276 462 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 RBP5P82980 135 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CDC42EP1Q00587 391 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CUL1Q13616 776 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 C7orf31Q8N865 590 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SCN1AP35498 2009 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 P4HA1P13674 534 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 AKR1A1P14550 325 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TCF4P15884 667 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA6P17066 643 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 NNTQ13423 1086 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SNX27Q96L92 541 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 JAMLQ86YT9 394 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 MED4Q9NPJ6 270 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 GABRQQ9UN88 632 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 RECQL4O94761 1208 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PAEPP09466 180 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CHRNA3P32297 505 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 OGDHQ02218 1023 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R5EQ16537 467 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 FAM71BQ8TC56 605 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 KLK14Q9P0G3 267 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 Q9Y3F1 56 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 MED7O43513 233 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 RNF40O75150 1001 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PSMC4P43686 418 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ1P48048 391 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 NDST1P52848 882 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 GNASQ5JWF2 1037 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 TRIB2Q92519 343 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-209ENST00000428120 PGK1P00558 417 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 FLT3P36888 993 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PTGIRP43119 386 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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