RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD51CO43502 376 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFS3O75489 264 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 AKR1B1P15121 316 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 STAT5BP51692 787 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA33Q96N06 139 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT87PA6NCN2 255 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ1P48048 391 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 XKR3Q5GH77 459 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CYGBQ8WWM9 190 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ALG6Q9Y672 507 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DISP2A7MBM2 1401 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GW55 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CAND2O75155 1236 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCBP05771 671 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ACOT2P49753 483 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RBP5P82980 135 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NCOA4Q13772 614 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 EFHBQ8N7U6 833 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX4Q9UBX2 424 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD14O00487 310 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO4Q32M45 955 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA18Q8TC71 538 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DYRK4Q9NR20 520 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NFIBO00712 420 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL2P10916 166 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS7P49802 495 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C12orf60Q5U649 245 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GID8Q9NWU2 228 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CST8O60676 142 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GSNP06396 782 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM253P0C7T8 217 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 COMTP21964 271 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 WASHC5Q12768 1159 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DPYDQ12882 1025 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KIZQ2M2Z5 673 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE7PQ495Y7 208 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 E2F7Q96AV8 911 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FOPNLQ96NB1 174 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN3BQ9NY72 215 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A1P19634 815 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K7CLP57077 242 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMB3Q13751 1172 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SCARF1Q14162 830 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC29A2Q14542 456 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CALML6Q8TD86 181 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ISCUQ9H1K1 167 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM205CA6NFA0 338 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC3O43617 180 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms