RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 OR1D2P34982 312 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ZNF445P59923 1031 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ADAM15Q13444 863 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 COL19A1Q14993 1142 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MIIPQ5JXC2 388 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 TSPY26PQ9H489 355 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 POLIQ9UNA4 740 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PLXNA3P51805 1871 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 SZT2Q5T011 3432 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ADAM12O43184 909 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 LRRN2O75325 713 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CLSTN1O94985 981 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TPM2P07951 284 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CLCN4P51793 760 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 KCNC3Q14003 757 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 KRT31Q15323 416 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 LILRA6Q6PI73 481 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 LMO3Q8TAP4 145 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 BCO2Q9BYV7 579 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 PALB2Q86YC2 1186 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 PPM1EQ8WY54 764 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TATDN2Q93075 761 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ACBD6Q9BR61 282 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ABLIM3O94929 683 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GLUD1P00367 558 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 PCSK1P29120 753 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TPM4P67936 248 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TPGS2Q68CL5 300 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GBP6Q6ZN66 633 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 OSTM1Q86WC4 334 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 SNX25Q9H3E2 840 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.121e-16■■■■■ 250
PMS1-211ENST00000424766 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 DPP7Q9UHL4 492 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 MAFFQ9ULX9 164 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TGM5O43548 720 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ASPAP45381 313 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CDH8P55286 799 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ARPP19P56211 112 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ROR1Q01973 937 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GPR17Q13304 367 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 LUZP1Q86V48 1076 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CASP10Q92851 521 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 NT5C1BQ96P26 610 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 SDCBP2Q9H190 292 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 VPS16Q9H269 839 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CDH23Q9H251 3354 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 WEE2P0C1S8 567 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CPB1P15086 417 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 EPCAMP16422 314 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TSPY1Q01534 308 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 SMARCB1Q12824 385 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 TTC39CQ8N584 583 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CLDND1Q9NY35 253 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 GCNT4Q9P109 453 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 CDH9Q9ULB4 789 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-211ENST00000424766 WDR27A2RRH5 827 aa22.02■■□□□ 1.12
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