RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DGKZQ13574 1117 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNG2Q16589 344 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 XKR9Q5GH70 373 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC125Q86Z20 511 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP4K3Q8IVH8 894 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM136AQ96C01 138 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CYLDQ9NQC7 956 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL11Q9NVR0 708 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP69BQ9UJL9 534 aa19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 NVLO15381 856 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CFHP08603 1231 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 NSFP46459 744 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR1Q13613 665 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PASD1Q8IV76 773 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 POMGNT1Q8WZA1 660 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 TEPSINQ96N21 525 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL8Q9BZF1 889 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PIDD1Q9HB75 910 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOC7Q9UPT5 735 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 USTQ9Y2C2 406 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PROSCO94903 275 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRC2P26717 231 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP24A1Q07973 514 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC1A5Q15758 541 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 RFWD3Q6PCD5 774 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN12Q6ZSI9 719 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MICALL2Q8IY33 904 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM81BQ96LP2 452 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD14AQ96MC6 490 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP57Q96MR6 1250 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf70Q9BRQ4 267 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM33Q9BZ11 813 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SAYSD1Q9NPB0 183 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 NMRK1Q9NWW6 199 aa19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBL1P10243 752 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 GCNT1Q02742 428 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 IRGCQ6NXR0 463 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 C4orf50Q6ZRC1 276 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP9Q7RTR0 991 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 OTOAQ7RTW8 1153 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRPQ86YL5 185 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 C4orf33Q8N1A6 199 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 BSNDQ8WZ55 320 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SMC6Q96SB8 1091 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SAR1AQ9NR31 198 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 LYPLA2O95372 231 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 VHLP40337 213 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K10Q02779 954 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MON1BQ7L1V2 547 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC2Q8TDI7 906 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MIPEPQ99797 713 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf112Q9NSG2 853 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 STOML1Q9UBI4 398 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 C2CD2Q9Y426 696 aa19.34■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP9AO75110 1047 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT15P19012 456 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DSG3P32926 999 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 RFC5P40937 340 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOT1Q8IXI2 618 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 GALNT15Q8N3T1 639 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP61Q8NHU2 1237 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 UCMAQ8WVF2 138 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF341Q9BYN7 854 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 HOMER2Q9NSB8 354 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa19.33■□□□□ 0.69
RALGPS1-208ENST00000424082 PI4K2BG5E9Z4 385 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 C2CD2LO14523 706 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FGFR1P11362 822 aa19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms