RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405943.3

HDGFP1-201, Transcript of heparin binding growth factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene HDGFP1, Length 252 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP1-201ENST00000405943 ENPEPQ07075 957 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 USP17L24Q0WX57 530 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 GPS1Q13098 491 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PPP2R5CQ13362 524 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TMED1Q13445 227 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 GRM2Q14416 872 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 DLGAP5Q15398 846 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SLC1A5Q15758 541 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 HIF1AQ16665 826 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 MMEL1Q495T6 779 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 LRRC38Q5VT99 294 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ANO5Q75V66 913 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 DHDDSQ86SQ9 333 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 FBXO11Q86XK2 927 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PALB2Q86YC2 1186 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PDSS2Q86YH6 399 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 CCNJLQ8IV13 435 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PDIK1LQ8N165 341 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ALLCQ8N6M5 410 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TTC13Q8NBP0 860 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SPOCK2Q92563 424 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SLC5A5Q92911 643 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 APOPT1Q96IL0 206 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 DYDC2Q96IM9 177 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 C7orf26Q96N11 449 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SETDB2Q96T68 719 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 CYTH2Q99418 400 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 KRT82Q9NSB4 513 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TAS2R1Q9NYW7 299 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 VAV3Q9UKW4 847 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 A0A1B0GUL6 1792 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa4.75□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 LAMB2P55268 1798 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 WDR91A4D1P6 747 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SFI1A8K8P3 1242 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 H3BRJ5 948 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 SGK1O00141 431 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 COPEO14579 308 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 BIRC5O15392 142 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 GAS7O60861 476 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 UPP2O95045 317 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 KRT1P04264 644 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ITGAVP06756 1048 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 INHBAP08476 426 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 ITGA2BP08514 1039 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 MYL2P10916 166 aa4.74□□□□□ -1.65
HDGFP1-201ENST00000405943 MYL4P12829 197 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms