RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401029.3

CAPNS1P1-201, Transcript of calpain small subunit 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CAPNS1P1, Length 633 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CFHP08603 1231 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GNA15P30679 374 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KYAT1Q16773 422 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM187BQ17R55 369 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMEM270Q6UE05 265 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ERO1BQ86YB8 467 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CCDC89Q8N998 374 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SNF8Q96H20 258 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BTBD6Q96KE9 485 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPR20Q99678 358 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MROH8Q9H579 483 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AZI2Q9H6S1 392 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AAASQ9NRG9 546 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GGA3Q9NZ52 723 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.9□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ARID2Q68CP9 1835 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UNCXA6NJT0 531 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RASGRF2O14827 1237 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HBP1O60381 514 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FSBPO95073 299 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IL18RAPO95256 599 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SHBGP04278 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EDN1P05305 212 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KCNJ1P48048 391 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SEC24CP53992 1094 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VGLL4Q14135 290 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TFDP1Q14186 410 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ACAP1Q15027 740 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PLCB4Q15147 1175 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RASA2Q15283 850 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PPP1R7Q15435 360 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TAZQ16635 292 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MAPK6Q16659 721 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TREML2Q5T2D2 321 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SCLT1Q96NL6 688 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CHST7Q9NS84 486 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CSADQ9Y600 493 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SIP14410 1827 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 E7EVH7 732 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MAGEB2O15479 319 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TJP3O95049 919 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRKCBP05771 671 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ABHD2P08910 425 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms