RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 CDC23Q9UJX2 597 aa6.49□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TFR2Q9UP52 801 aa6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.49□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CLDN3O15551 220 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 B4GALT4O60513 344 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TADA3O75528 432 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 VNN1O95497 513 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 IQCF3P0C7M6 154 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF286BP0CG31 522 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GRIK1P39086 918 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ACOT2P49753 483 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MFAP3P55082 362 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42EP1Q00587 391 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PPFIA1Q13136 1202 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SURF1Q15526 300 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CCL14Q16627 93 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.48□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.48□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF410Q86VK4 478 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 VPS36Q86VN1 386 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 WDR49Q8IV35 697 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD7Q92527 254 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NT5C1BQ96P26 610 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 RAXQ9Y2V3 346 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NCANO14594 1321 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PTPRJQ12913 1337 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NRCAMQ92823 1304 aa6.48□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087WZ62 844 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GUA9 196 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KPNA6O60684 536 aa6.47□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 GPR32O75388 356 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TACC1O75410 805 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 HLA-DRAP01903 254 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GJB1P08034 283 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 MCF2P10911 925 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GZMAP12544 262 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CYBAP13498 195 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CHRNB2P17787 502 aa6.47□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 TMOD1P28289 359 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CYP2C19P33261 490 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TUBB4BP68371 445 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ARID5AQ03989 594 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TEAD4Q15561 434 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KYAT1Q16773 422 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.47□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TLK2Q86UE8 772 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 METTL13Q8N6R0 699 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 UBR7Q8N806 425 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TRPV1Q8NER1 839 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.47□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.47□□□□□ -1.37
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