RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389398.9

VWA3A-202, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene VWA3A, Length 4,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-202ENST00000389398 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 BIRC5O15392 142 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ARL4AP40617 200 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ACAP1Q15027 740 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SNX17Q15036 470 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 RESP18Q5W5W9 173 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PACS1Q6VY07 963 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 AGR3Q8TD06 166 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 RFFLQ8WZ73 363 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 MS4A14Q96JA4 679 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 C9orf72Q96LT7 481 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 NEMP1O14524 444 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ITGA1P56199 1179 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ITKQ08881 620 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 RASA2Q15283 850 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 STAP2Q9UGK3 403 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ADCY9O60503 1353 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 METP08581 1390 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 A0A1B0GTH6 734 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 CLRN2A0PK11 232 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PHF2O75151 1096 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 CCNA2P20248 432 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 GSSP48637 474 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SLC9A3P48764 834 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ARPP19P56211 112 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SIK1P57059 783 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 COX10Q12887 443 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 RDM1Q8NG50 284 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 NUAK2Q9H093 628 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 VPS4AQ9UN37 437 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SERPINB9P50453 376 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 DGKZQ13574 1117 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 QPRTQ15274 297 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 DPF2Q92785 391 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 GCNAQ96QF7 691 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 MAST3O60307 1309 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PTCH1Q13635 1447 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 A0A0D9SFI3 127 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 GP5P40197 560 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 NCF4Q15080 339 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3A-202ENST00000389398 COPS6Q7L5N1 327 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms