RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 PROSCO94903 275 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 MAMLD1Q13495 774 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 KYNUQ16719 465 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa25.29■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 GJB6O95452 261 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 PTP4A2Q12974 167 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA21Q7Z572 469 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 UBR7Q8N806 425 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ATL2Q8NHH9 583 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ECT2Q9H8V3 914 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 SBF1O95248 1867 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 TOM1L1O75674 476 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 BRAFP15056 766 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 BNIP1Q12981 228 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD42Q8N9B4 389 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR20Q99678 358 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 NINJ2Q9NZG7 142 aa25.28■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF132P52740 706 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 TCHPQ9BT92 498 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ABLIM1O14639 778 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ADCY8P40145 1251 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 EFNA5P52803 228 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS2R40P59535 323 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 LIN9Q5TKA1 542 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 IER5Q5VY09 327 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM167AQ96KS9 214 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ALADP13716 330 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 COPS2P61201 443 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC125Q86Z20 511 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR49Q8IV35 697 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 SULF1Q8IWU6 871 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF149Q8NC42 400 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 BBOF1Q8ND07 529 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 VCPIP1Q96JH7 1222 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.26■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CDH16O75309 829 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ2P63252 427 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MPP2Q14168 576 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MOB2Q70IA6 237 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RELL1Q8IUW5 271 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 EBF2Q9HAK2 575 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GGT7Q9UJ14 662 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 NEU2Q9Y3R4 380 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTL7BQ9Y614 415 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MCM3APO60318 1980 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 LGR5O75473 907 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MYL6P60660 151 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 Q3C1V9 767 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGEB18Q96M61 343 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1B0GUA9 196 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKCBP05771 671 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 STX2P32856 288 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GDAP1Q8TB36 358 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM212AQ96EL1 285 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GH1P01241 217 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 GRM1Q13255 1194 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4X1Q8N118 509 aa25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms