RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356150.9

SH3YL1-201, Transcript of SH3 and SYLF domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3YL1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1-201ENST00000356150 HACE1Q8IYU2 909 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 BTBD6Q96KE9 485 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ALG6Q9Y672 507 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ITIH3Q06033 890 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 PADI3Q9ULW8 664 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 CEP83Q9Y592 693 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ITGA4P13612 1032 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 CYP3A5P20815 502 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 NDST1P52848 882 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 PTP4A2Q12974 167 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 LPIN1Q14693 890 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 FAM26DQ5JW98 314 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ZNF560Q96MR9 790 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ANAPC7Q9UJX3 599 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 PIRO00625 290 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 MMP8P22894 467 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ZFP42Q96MM3 310 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1-201ENST00000356150 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PTGESO14684 152 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 COMTP21964 271 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 CEP104O60308 925 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 CAND2O75155 1236 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 CALB1P05937 261 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 SCINQ9Y6U3 715 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 KBTBD13C9JR72 458 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 VDRP11473 427 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MLH1P40692 756 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PNPLA4P41247 253 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 LPPQ93052 612 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 LHX5Q9H2C1 402 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PHF24Q9UPV7 400 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 SPOPO43791 374 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MGEA5O60502 916 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 TAF6P49848 677 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 RAB27AP51159 221 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 SGO2Q562F6 1265 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 TRIM7Q9C029 511 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MICAL2O94851 1124 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 MAMLD1Q13495 774 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 DSC3Q14574 896 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 SV2CQ496J9 727 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 DPH6Q7L8W6 267 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 ERICH1Q86X53 443 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 USP38Q8NB14 1042 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 GAD1Q99259 594 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PARVAQ9NVD7 372 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 KPNA7A9QM74 516 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 O00370 1275 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1-201ENST00000356150 SPTLC1O15269 473 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms