RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SART1O43290 800 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SPOPO43791 374 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D4O60343 1298 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN3O60637 253 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NBNO60934 754 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SRGAP2O75044 1071 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GALTP07902 379 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CD72P21854 359 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SEC13P55735 322 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DRP2Q13474 957 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DDR2Q16832 855 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CPA6Q8N4T0 437 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF21Q96ID5 467 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GDF15Q99988 308 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAF1Q9H063 256 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 STAP1Q9ULZ2 295 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FOCADQ5VW36 1801 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM170BA6NMN3 283 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K7O43318 606 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD10O75832 226 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 APODP05090 189 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ARL4DP49703 201 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 AP3M2P53677 418 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TAP1Q03518 808 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ITIH3Q06033 890 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 UNC13DQ70J99 1090 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ERICH1Q86X53 443 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PASD1Q8IV76 773 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CCNYQ8ND76 341 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PIGKQ92643 395 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ASIC4Q96FT7 647 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SPACA7Q96KW9 195 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PLVAPQ9BX97 442 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KCND2Q9NZV8 630 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MYH6P13533 1939 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF862O60290 1169 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C22orf31O95567 290 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNA1P02708 482 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SLFN14P0C7P3 912 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EPCAMP16422 314 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CREB5Q02930 508 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 STX1AQ16623 288 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KRT39Q6A163 491 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ANO7Q6IWH7 933 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RRAGAQ7L523 313 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HMGB4Q8WW32 186 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3R5Q8WYR1 880 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 OMDQ99983 421 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BBS2Q9BXC9 721 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GPR88Q9GZN0 384 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CDT1Q9H211 546 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 INVSQ9Y283 1065 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LCHNA4D1U4 455 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 OR6C75A6NL08 312 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 M0R2N6 131 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EXTL3O43909 919 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATG13O75143 517 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATICP31939 592 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TERF1P54274 439 aa4.71□□□□□ -1.66
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