RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 EP400NLQ6ZTU2 488 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 FAXDC2Q96IV6 333 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 SMTNL1A8MU46 457 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 TACC1O75410 805 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 CAVIN2O95810 425 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRF2Q8IZF7 708 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF461Q8TAF7 563 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ18B7U540 433 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 GABRDO14764 452 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 LINC01565O15544 149 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM12O43184 909 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 TGM5O43548 720 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF165P49910 485 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 MYL7Q01449 175 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ12Q14500 433 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 SEMA4DQ92854 862 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ACBD6Q9BR61 282 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 PI4K2AQ9BTU6 479 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 FANCLQ9NW38 375 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 MAFFQ9ULX9 164 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 GLP2RO95838 553 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 EPCAMP16422 314 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 WARSP23381 471 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ARPP19P56211 112 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 NOP14P78316 857 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 MAN2A1Q16706 1144 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 CDKAL1Q5VV42 579 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 TPGS2Q68CL5 300 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 SNX25Q9H3E2 840 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 DZANK1Q9NVP4 752 aa28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ABLIM3O94929 683 aa28.66■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 PCSK1P29120 753 aa28.66■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 ROR1Q01973 937 aa28.66■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa28.66■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 POLIQ9UNA4 740 aa28.66■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 CPB1P15086 417 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 LTBRP36941 435 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCB1Q12824 385 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 GPR17Q13304 367 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 SPOPLQ6IQ16 392 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 RTL10Q7L3V2 364 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 AOPEPQ8N6M6 819 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 KREMEN2Q8NCW0 462 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 RTP3Q9BQQ7 232 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 CYP3A43Q9HB55 503 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 WDR27A2RRH5 827 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ATF2P15336 505 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ELF1P32519 619 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TSPY1Q01534 308 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 NCAPHQ15003 741 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD54Q6NXT1 300 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 OR6B3Q8NGW1 331 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 NIF3L1Q9GZT8 377 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC1BQ9P126 229 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 TPM2P07951 284 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31D3P0C874 917 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 UVSSAQ2YD98 709 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 VWA3BQ502W6 1294 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 EHBP1Q8NDI1 1231 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 OR10T2Q8NGX3 314 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 BCO2Q9BYV7 579 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 NDST4Q9H3R1 872 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 FBXW11Q9UKB1 542 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 COL6A3P12111 3177 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SPDYE4A6NLX3 237 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 BECN2A8MW95 431 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 LRRN2O75325 713 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA5P22460 613 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ASPAP45381 313 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC149Q6ZUS6 474 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 OSTM1Q86WC4 334 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 ELMO3Q96BJ8 720 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIP1-201ENST00000330233 SMYD3Q9H7B4 428 aa28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms