RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325805.12

BBX-201, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BBX, Length 3,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-201ENST00000325805 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 FIG4Q92562 907 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 KRT35Q92764 455 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 CHID1Q9BWS9 393 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 HEY2Q9UBP5 337 aa6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 HDAC3O15379 428 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ZNF862O60290 1169 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 RGS20O76081 388 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 FGGP02679 453 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 FOSL2P15408 326 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 VCLP18206 1134 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 BMP6P22004 513 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 HNF1BP35680 557 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 TXKP42681 527 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 OCA2Q04671 838 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 AP1B1Q10567 949 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 STRN3Q13033 797 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 MTM1Q13496 603 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 CUL1Q13616 776 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SPARCL1Q14515 664 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SLC39A14Q15043 492 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 LRRC6Q86X45 466 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 IFNL1Q8IU54 200 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ESX1Q8N693 406 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ESR2Q92731 530 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 THAP9Q9H5L6 903 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 A8MUA0 341 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 I3L4J1 428 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 CHL1O00533 1208 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 CYP26A1O43174 497 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PHF2O75151 1096 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SCO1O75880 301 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PRKCBP05771 671 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ITGA4P13612 1032 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ANPEPP15144 967 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SLC1A4P43007 532 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NT5C2P49902 561 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 DSTNP60981 165 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 CDC16Q13042 620 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GRM1Q13255 1194 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 TRPC3Q13507 836 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GEN1Q17RS7 908 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ARSHQ5FYA8 562 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 KRT40Q6A162 431 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GPR141Q7Z602 305 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NRG4Q8WWG1 115 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GDAQ9Y2T3 454 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 FLT1P17948 1338 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 BTBD18B2RXH4 712 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 PSMA7O14818 248 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ASNA1O43681 348 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UGT1A9O60656 530 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NDUFS2O75306 463 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UGT1A6P19224 532 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UGT1A1P22309 533 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UGT1A4P22310 534 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 CTNNA2P26232 953 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 GNA11P29992 359 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UGT1A3P35503 534 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 UGT1A5P35504 534 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 AQP4P55087 323 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 KCNQ4P56696 695 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NUP107P57740 925 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 BNIP3Q12983 259 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 NECTIN1Q15223 517 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 ZNF174Q15697 407 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.05□□□□□ -1.44
BBX-201ENST00000325805 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms