RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.4■■□□□ 1.02
PARL-201ENST00000311101 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.39■■□□□ 1.02
PARL-201ENST00000311101 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.39■■□□□ 1.02
PARL-201ENST00000311101 MTMR11A4FU01 709 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 KIF20AO95235 890 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TWF1Q12792 350 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 DUSP4Q13115 394 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SPATA20Q8TB22 786 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ITFG1Q8TB96 612 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 HPDLQ96IR7 371 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 YIPF1Q9Y548 306 aa21.39■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 RHOP08100 348 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 MYO1EQ12965 1108 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CEP135Q66GS9 1140 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CENPPQ6IPU0 288 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 GSDMAQ96QA5 445 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 RMND1Q9NWS8 449 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CEP72Q9P209 647 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.38■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TMEM221A6NGB7 291 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 M0R296 226 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 HUS1O60921 280 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 LAMP2P13473 410 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 DLG4P78352 724 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CLDN10P78369 228 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 NFIL3Q16649 462 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 OSTM1Q86WC4 334 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SMARCE1Q969G3 411 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CORO1BQ9BR76 489 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 KCNK12Q9HB15 430 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 NOTCH4Q99466 2003 aa21.37■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 HCRTO43612 131 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SOAT2O75908 522 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SMC2O95347 1197 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PTPN2P17706 415 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 NR2F2P24468 414 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PRCPP42785 496 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 MTMR3Q13615 1198 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ING5Q8WYH8 240 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 FGF13Q92913 245 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CDH7Q9ULB5 785 aa21.36■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 GABRDO14764 452 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 KINO60870 393 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 AKAP3O75969 853 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 MYL6P60660 151 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 POTEHQ6S545 545 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.35■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CCR2P41597 374 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 CCDC142Q17RM4 750 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ISM2Q6H9L7 571 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ELMOD1Q8N336 334 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 TMC2Q8TDI7 906 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ASIC4Q96FT7 647 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.34■■□□□ 1.01
PARL-201ENST00000311101 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms