RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 LTBRP36941 435 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 ASPAP45381 313 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 STK39Q9UEW8 545 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 TBX10O75333 385 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF280DQ6N043 979 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 CLDND1Q9NY35 253 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 ADH1AP07327 375 aa9.74□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 NDUFV1P49821 464 aa9.74□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 TNNC1P63316 161 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 TFF2Q03403 129 aa9.74□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 COL19A1Q14993 1142 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 MAN2A1Q16706 1144 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 PTPN21Q16825 1174 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.74□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 NDST4Q9H3R1 872 aa9.74□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 CLEC1BQ9P126 229 aa9.74□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 H7C4K7 107 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 TWNKQ96RR1 684 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 PMM2O15305 246 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 TACC1O75410 805 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-201ENST00000309641 CD58P19256 250 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-201ENST00000309641 KCNA5P22460 613 aa9.73□□□□□ -0.85
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