RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R2P41236 205 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 VAMP7P51809 220 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 LRRC63Q05C16 580 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 STIM1Q13586 685 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TSG101Q99816 390 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CLUHO75153 1309 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 IKBKBO14920 756 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CETN3O15182 167 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 XYLBO75191 536 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CCNE1P24864 410 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ENPEPQ07075 957 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 BIRC3Q13489 604 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TRPC3Q13507 836 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ZACNQ401N2 412 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 SPATA18Q8TC71 538 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.142e-9■□□□□ 8.4
RNPS1-201ENST00000301730 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 USTQ9Y2C2 406 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 NR2E1Q9Y466 385 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 MTMR11A4FU01 709 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 PHACTR2O75167 634 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 VNN1O95497 513 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 MYL6P60660 151 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 DPH6Q7L8W6 267 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 OSTM1Q86WC4 334 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 GABRDO14764 452 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 LRG1P02750 347 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM49P0CI25 452 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM49CP0CI26 452 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 KRT13P13646 458 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ATICP31939 592 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 NCOA4Q13772 614 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 SV2AQ7L0J3 742 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 RNF135Q8IUD6 432 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 POLIQ9UNA4 740 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 NOTCH4Q99466 2003 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 LHX1P48742 406 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 MYL7Q01449 175 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 PPP3CAQ08209 521 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ACBD6Q9BR61 282 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 YIPF1Q9Y548 306 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 NTHL1P78549 312 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TSPY1Q01534 308 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 DUSP4Q13115 394 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF699Q32M78 642 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TTI2Q6NXR4 508 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 NELFBQ8WX92 580 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 MMS19Q96T76 1030 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-201ENST00000301730 HCRTO43612 131 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-201ENST00000301730 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-201ENST00000301730 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-201ENST00000301730 GCLMP48507 274 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms