RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC93AQ86WB7 457 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 RABGGTAQ92696 567 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CASD1Q96PB1 797 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 TWNKQ96RR1 684 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP8B3O60423 1300 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CYB561D2O14569 222 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT86O43790 486 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 CD19P15391 556 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP25P42331 645 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-201ENST00000298838 RCCD1A6NED2 376 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DDHD2O94830 711 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 GZMAP12544 262 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ORC1Q13415 861 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN14Q15678 1187 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SENP8Q96LD8 212 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TFR2Q9UP52 801 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PJA2O43164 708 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 AMHP03971 560 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 H2AFZP0C0S5 128 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM163BP0C2L3 166 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 GATMP50440 423 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 H2AFVQ71UI9 128 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX25Q9H3E2 840 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 IL23AQ9NPF7 189 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 A8MXQ7 604 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 MED7O43513 233 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 B4GALT3O60512 393 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 BAIAP3O94812 1187 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC43Q8N309 656 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 INTUQ9ULD6 942 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 RTN2O75298 545 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 UPP2O95045 317 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF4AO95239 1232 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.127e-8■□□□□ 11.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TFAP2BQ92481 460 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ISCUQ9H1K1 167 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ACRP10323 421 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 VDRP11473 427 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ODC1P11926 461 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 OR1G1P47890 313 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SGO2Q562F6 1265 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 HASPINQ8TF76 798 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TSC2P49815 1807 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF5CO60282 957 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ABL1P00519 1130 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 GALCP54803 685 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 FPGSQ05932 587 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 WSCD1Q658N2 575 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PASD1Q8IV76 773 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.04■■□□□ 1.12
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