RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 AP2B1P63010 937 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SV2AQ7L0J3 742 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TTC7BQ86TV6 843 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SEMA4DQ92854 862 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TRIM11Q96F44 468 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 BTBD10Q9BSF8 475 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 HEY1Q9Y5J3 304 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PIK3CDO00329 1044 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CFLARO15519 480 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 STK10O94804 968 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PSMA2P25787 234 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PTK6Q13882 451 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MTERF2Q49AM1 385 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 KCTD6Q8NC69 237 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 APOL6Q9BWW8 343 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SENP1Q9P0U3 644 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ADRB2P07550 413 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1B1P15313 513 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TAS2R40P59535 323 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC34A1Q06495 639 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ZBTB33Q86T24 672 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 WDR18Q9BV38 432 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 GRIK3Q13003 919 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PRKG1Q13976 671 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RASA2Q15283 850 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 AAASQ9NRG9 546 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 FCHO1O14526 889 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 AHCYL1O43865 530 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PYGBP11216 843 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TRIP10Q15642 601 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 NLRX1Q86UT6 975 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 FAM81BQ96LP2 452 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CST8O60676 142 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PSMG1O95456 288 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ASPHQ12797 758 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PDK4Q16654 411 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FAF2Q96CS3 445 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 COX16Q9P0S2 106 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FSCN2O14926 492 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MTMR1Q13613 665 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 LGSNQ5TDP6 509 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 NUP98P52948 1817 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 WDR64B1ANS9 1081 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 MCF2LO15068 1137 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 BMPR2Q13873 1038 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 ACER1Q8TDN7 264 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 INPP5DQ92835 1189 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-201ENST00000285679 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms