RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ATP2A1O14983 1001 aa29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 SLC18A1P54219 525 aa29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ALLCQ8N6M5 410 aa29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 UBR7Q8N806 425 aa29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 TMEM134Q9H6X4 195 aa29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ZNF302Q9NR11 478 aa29.6■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GUA9 196 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 KRT1P04264 644 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 WRNIP1Q96S55 665 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ACAD9Q9H845 621 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 PPCSQ9HAB8 311 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 SAYSD1Q9NPB0 183 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 KLHL14Q9P2G3 628 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 DNPEPQ9ULA0 475 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ZNF148Q9UQR1 794 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ATG7O95352 703 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 PTPRAP18433 802 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 TAP1Q03518 808 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 MORF4L2Q15014 288 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 TMED2Q15363 201 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 CYP4F22Q6NT55 531 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A3Q8WY07 619 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 C12orf42Q96LP6 360 aa29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 TAC1P20366 129 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ATP4AP20648 1035 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 CCDC15Q0P6D6 951 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 TRABD2AQ86V40 505 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 SENP1Q9P0U3 644 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 FBXO40Q9UH90 709 aa29.58■■■□□ 2.33
UBP1-201ENST00000283628 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 CCDC142Q17RM4 750 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PICK1Q9NRD5 415 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PI4K2BG5E9Z4 385 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.326e-7■■□□□ 11.8
UBP1-201ENST00000283628 KRT10P13645 584 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ARSEP51690 589 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GRM1Q13255 1194 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 KAZNQ674X7 775 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SMYD5Q6GMV2 418 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 CGB2Q6NT52 195 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 MFSD7Q6UXD7 560 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GPC2Q8N158 579 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 KLHL11Q9NVR0 708 aa29.57■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 MAGEB2O15479 319 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC24Q6P3W2 148 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PRUNE1Q86TP1 453 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 FITM2Q8N6M3 262 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GGA3Q9NZ52 723 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GGT7Q9UJ14 662 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ASS1P00966 412 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ALADP13716 330 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ICAM3P32942 547 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 RFC5P40937 340 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 VCPP55072 806 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 RASA2Q15283 850 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PLCD3Q8N3E9 789 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GIMAP7Q8NHV1 300 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 KLHL29Q96CT2 875 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PITPNM3Q9BZ71 974 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SHOC2Q9UQ13 582 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.56■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ITGAVP06756 1048 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GCAP28676 217 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 NF2P35240 595 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TFDP3Q5H9I0 405 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SEPT14Q6ZU15 432 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 WDR49Q8IV35 697 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TMEM35BQ8NCS4 154 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF3Q9NR81 526 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
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