RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 CLPTM1O96005 669 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GZMAP12544 262 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GTF2H1P32780 548 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SERPINB8P50452 374 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 AAGABQ6PD74 315 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SLC51AQ86UW1 340 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 RDH13Q8NBN7 331 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GAB3Q8WWW8 586 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 S100A14Q9HCY8 104 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 RALAP11233 206 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 FUT4P22083 530 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 MAPK4P31152 587 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 COG7P83436 770 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 DLGAP5Q15398 846 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ERMNQ8TAM6 284 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PPCSQ9HAB8 311 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 EML1O00423 815 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SMIM18P0DKX4 95 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SLC1A1P43005 524 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NCOA4Q13772 614 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 CCNG2Q16589 344 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TREML1Q86YW5 311 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 MYCT1Q8N699 235 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SMYD1Q8NB12 490 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 CEP95Q96GE4 821 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ACP6Q9NPH0 428 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 CAPN14A8MX76 684 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 F5H6K3 240 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TFAP2AP05549 437 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 BGNP21810 368 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 KLRC2P26717 231 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 KLRK1P26718 216 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PEX2P28328 305 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 CD97P48960 835 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 EMP3P54852 163 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 XIAPP98170 497 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ITPK1Q13572 414 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NADK2Q4G0N4 442 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 LMO3Q8TAP4 145 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 SLC35B4Q969S0 331 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 TTC17Q96AE7 1141 aa7.59□□□□□ -1.19
CSDE1-201ENST00000261443 MAF1Q9H063 256 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms