RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 F8VP50 259 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PEX10O60683 326 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 KRT10P13645 584 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 OGDHQ02218 1023 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 MAPK6Q16659 721 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 P3H1Q32P28 736 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJC24Q6P3W2 148 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC77Q9BR77 488 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.32■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SNX3O60493 162 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 MAGEA4P43358 317 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC142Q17RM4 750 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CYP4X1Q8N118 509 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ALLCQ8N6M5 410 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 MCEEQ96PE7 176 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 KRT1P04264 644 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PRKCBP05771 671 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CETPP11597 493 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PROZP22891 400 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 NF2P35240 595 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 XRCC4Q13426 336 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 VGLL4Q14135 290 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 DCUN1D2Q6PH85 259 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TFAP2BQ92481 460 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 KLC4Q9NSK0 619 aa18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 LGR5O75473 907 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 GSTA1P08263 222 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 HOXC6P09630 235 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 BRAFP15056 766 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 MPP2Q14168 576 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PRUNE1Q86TP1 453 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 GLIS1Q8NBF1 620 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 RNF149Q8NC42 400 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CKAP2Q8WWK9 683 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 C9orf72Q96LT7 481 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 B4GALT4O60513 344 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ASPAP45381 313 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TRPC3Q13507 836 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC14Q15048 493 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 OASLQ15646 514 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 LY6KQ17RY6 165 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 KAZNQ674X7 775 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ERICH1Q86X53 443 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 DYDC1Q8WWB3 177 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 GPR20Q99678 358 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SLC12A4Q9UP95 1085 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF148Q9UQR1 794 aa18.3■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CDKN2BP42772 138 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PRKG1Q13976 671 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF394Q53GI3 561 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 FUKQ8N0W3 1084 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 MAML1Q92585 1016 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CFAP57Q96MR6 1250 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 CEP83Q9Y592 693 aa18.29■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 WDR90Q96KV7 1748 aa18.28■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TCP11X1B4DZS4 312 aa18.28■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 ITGAVP06756 1048 aa18.28■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 WEE2P0C1S8 567 aa18.28■□□□□ 0.52
CLDN11-201ENST00000064724 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms