RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041055.8

Atg2b-201, Transcript of Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg2b, Length 7,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm8926L7MUE8 181 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tlk2O55047 718 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 HunkO88866 714 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rad54lP70270 747 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GclcP97494 637 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trim47Q8C0E3 641 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CpdO89001 1377 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 AV320801A2AWL3 467 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm15023L7MUB4 467 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ttc7aQ8BGB2 858 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc13a3Q91Y63 600 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 OoepQ9CWE6 164 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dip2bQ3UH60 1574 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rrm1P07742 792 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PorP37040 678 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem237Q3V0J1 427 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nr1h4Q60641 488 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Map3k10Q66L42 940 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Adcy2Q80TL1 1090 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TwnkQ8CIW5 685 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Def8Q99J78 448 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 RpainQ9CWY9 219 aa13.06□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm10639E9Q6L7 222 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gsta2P10648 222 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CblP22682 913 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nedd1P33215 660 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 S100a13P97352 98 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mxd4Q60948 209 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Chsy1Q6ZQ11 800 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem260Q8BMD6 703 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem120aQ8C1E7 343 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Btbd6Q8K2J9 488 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam49bQ921M7 324 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Myo1cQ9WTI7 1063 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Arih1Q9Z1K5 555 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lonrf1D3YY23 762 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm3264L7N2C5 238 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 AurkcO88445 282 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 KitP05532 979 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfm4Q3UZZ4 505 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 BegainQ68EF6 600 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trpm8Q8R4D5 1104 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trmt11Q9CWH5 460 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PrameQ9D4Z5 464 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Usp29Q9ES63 869 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rgs9O54828 675 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rhbdl3P58873 404 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Xlr3aQ60595 226 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pdlim2Q8R1G6 349 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GhdcQ99J23 532 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gid8Q9D7M1 228 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ap3d1O54774 1199 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 LeprP48356 1162 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Chrna5Q2MKA5 467 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gprin1Q3UNH4 932 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfr8Q60892 310 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfp512bQ6PHP4 879 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem270Q6UJB9 264 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Usp6nlQ80XC3 819 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prr33Q8C494 260 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Uchl3Q9JKB1 230 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CdylQ9WTK2 593 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pstpip1P97814 415 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Faf2Q3TDN2 445 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam8a1Q3URQ4 399 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm136Q3V037 328 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 OgtQ8CGY8 1046 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Klra17Q9JMA4 273 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gyg1Q9R062 333 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfyve9A2A8R0 1397 aa13.05□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Osbpl7A2A716 963 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Speer4cG3UXD1 256 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm17019K7N6W5 255 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 HdcP23738 662 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hspa1aQ61696 641 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm9758Q80ZT2 255 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PpihQ9D868 188 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 EcsitQ9QZH6 435 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Crabp2P22935 138 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lpar1P61793 364 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Grm6Q5NCH9 871 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pacsin1Q61644 441 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lrig3Q6P1C6 1117 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccdc151Q8BSN3 593 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trim35Q8C006 501 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ngly1Q9JI78 651 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfr726E9Q8X3 321 aa13.04□□□□□ -0.32
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TpbpaP13438 124 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms