RNA–Protein interactions for RNA: YPR080W

TEF1, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF1, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF1	YPR080W	RPL39	P04650	51 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	QCR9	P22289	66 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	GPI18	P38211	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	HXT14	P42833	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PIR5	P46999	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YJR056C	P47115	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	HHO1	P53551	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	WSC2	P53832	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	TMA23	Q03525	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	FSH2	Q05015	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ATG5	Q12380	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ATP10	P18496	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	APA2	P22108	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	REC104	P33323	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ECM14	P38836	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YER121W	P40076	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	DCS1	Q06151	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SEC59	P20048	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	MRS4	P23500	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SPC29	P33419	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YNR064C	P53750	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	AHT1	P29589	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	UPS2	P35200	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	RIB5	P38145	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YAP1802	P53309	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PAU4	P53427	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	HCH1	P53834	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ADD37	Q03233	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SNA4	Q07549	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	FCY2	P17064	533 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	FPR2	P32472	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	IES6	P32617	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	MRPL4	P36517	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YGR269W	P40326	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PGD1	P40356	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	SBH2	P52871	88 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YGL262W	P53054	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	RAD28	Q12021	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	ATP16	Q12165	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TEF1	YPR080W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YCR025C	P25352	136 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	DAL3	P32459	195 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PMU1	P36069	295 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	CUE1	P38428	203 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU13	P38725	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YHL044W	P38727	235 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	WSS1	P38838	269 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	DFG10	P40526	253 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU10	Q03050	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	ARR2	Q06597	130 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU20	Q08322	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	SPO13	P23624	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	TRS20	P38334	175 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	PHS1	P40857	217 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	SAS2	P40963	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	MOG1	P47123	218 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YGL114W	P53134	725 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	TIM21	P53220	239 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	BOR1	P53838	576 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	STD1	Q02794	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TEF1	YPR080W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.4 ms