RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	MDH2	P22133	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	POP5	P28005	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	MRPS9	P38120	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAC2	P39937	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	ATG21	Q02887	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	TDA6	Q06466	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	RFU1	Q08003	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	FRE8	Q12209	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	MRS4	P23500	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	AME1	P38313	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	SEN34	P39707	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	HIT1	P46973	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	TNA1	P53322	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU4	P53427	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	FSH2	Q05015	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	HOF1	Q05080	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	COQ11	Q05892	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	THI72	Q08579	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PRR2	Q12310	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YCR025C	P25352	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	LSB5	P25369	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YBR013C	P38215	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	FLO5	P38894	1075 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	AVO2	Q04749	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	AKR2	Q12013	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	RAD28	Q12021	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	FCY22	Q12119	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	IZH2	Q12442	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	SAG1	P20840	650 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YOX1	P34161	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	UPS2	P35200	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	UTH1	P36135	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	SWD3	P38123	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU13	P38725	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	FLX1	P40464	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PDR17	P53844	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU10	Q03050	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	NDE2	Q07500	545 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU20	Q08322	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BRF1	YGR246C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	AHT1	P29589	182 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	SSS1	P35179	80 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	HSP10	P38910	106 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	NRM1	P53718	249 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	ARL3	Q02804	198 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	MIX14	Q04341	121 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	RRG8	Q06109	277 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	PIN3	Q06449	215 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	MED7	Q08278	222 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	FLO9	P39712	1322 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	PAU3	P25610	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	MCH2	P36032	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	CMC1	P36064	111 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	YIL029C	P40538	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	ERV14	P53173	138 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	TSA2	Q04120	196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	QCR9	P22289	66 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	ECO1	P43605	281 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	TAX4	P47030	604 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	UPS1	Q05776	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	HRD1	Q08109	551 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	ERV2	Q12284	196 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BRF1	YGR246C	YOP1	Q12402	180 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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