RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W TVP15Q03860 143 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W AVO2Q04749 426 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W INM2Q05533 292 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ANT1Q06497 328 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W HEM25Q07534 307 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SOR2Q07786 357 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YOR376WQ08900 122 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YPR203WQ08994 102 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W EAF3Q12432 401 aa2.98□□□□□ -1.93
VFA1YER128W BUD3P25558 1636 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YLR302CO13544 120 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPL12BP0CX54 165 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TY2A-FP0CX61 438 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W HMRA1P0CY11 126 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W UBC5P15732 148 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YCR102CP25608 368 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MRP17P28778 131 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W IES6P32617 166 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ZRT1P32804 376 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SFK1P35735 353 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YKR041WP36134 250 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TRR2P38816 342 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W IRC22P40006 225 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PRM5P40476 318 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W APQ12P40532 138 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CAT5P41735 233 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TTI2P47168 421 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YGR149WP48236 432 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MSY1P48527 492 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W BIO4P53630 237 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YNL033WP53964 284 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YNL019CP53975 284 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MRX11Q03079 207 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W NAT3Q06504 195 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CTR3Q06686 241 aa2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MOT1P32333 1867 aa2.96□□□□□ -1.93
VFA1YER128W FMP49A0A023PZB3 126 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RIP1P08067 215 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PAU19P0CE85 124 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PAU21P0CE86 164 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PAU22P0CE87 164 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PAU3P25610 124 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W NTF2P33331 125 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MCR1P36060 302 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RTC2P38279 296 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W NDT80P38830 627 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W AVT2P39981 480 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W POP1P41812 875 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PAM16P42949 149 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W LCB3P47013 409 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YIP5P53108 310 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YGR039WP53225 103 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W WSC2P53832 503 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W DUG3P53871 357 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PGA1P53896 198 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SDC1Q03323 175 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W UPS1Q05776 175 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ARR3Q06598 404 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PRM3Q08931 133 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YPL264CQ08980 353 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YPQ1Q12010 308 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PEX11Q12462 236 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W BOL1Q3E793 110 aa2.96□□□□□ -1.94
VFA1YER128W HIS1P00498 297 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W COX10P21592 462 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TRX3P25372 127 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W PEX34P25584 144 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SKN1P33336 771 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W MIX23P38162 196 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ATX1P38636 73 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W TEM1P38987 245 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ELO1P39540 310 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YEA4P40004 342 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W DLS1P40366 167 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W EMC5P40540 141 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YFR020WP43600 232 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W OST2P46964 130 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W YGL260WP53056 76 aa2.95□□□□□ -1.94
VFA1YER128W SDT1P53078 280 aa2.95□□□□□ -1.94
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