RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	TECPR2	O15040	1411 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MED17-223	ENST00000640077	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TEX33	O43247	280 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SGTA	O43765	313 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MST1R	Q04912	1400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CRHR2	Q13324	411 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	BIRC2	Q13490	618 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	EXTL1	Q92935	676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	EDNRB	P24530	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TRDN	Q13061	729 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MTA1	Q13330	715 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CSRP2	Q16527	193 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CEP72	Q9P209	647 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	LAMC1	P11047	1609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MATN3	O15232	486 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PEX11B	O96011	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	INSRR	P14616	1297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MGAT1	P26572	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CLRN1	P58418	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MTM1	Q13496	603 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DPF2	Q92785	391 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	USP19	O94966	1318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077		H0YHG0	523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	WNT10B	O00744	389 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TRIM24	O15164	1050 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	AMY1A	P04745	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	VCAM1	P19320	739 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HK1	P19367	917 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MCL1	Q07820	350 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	FOXE3	Q13461	319 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms