RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637848.1

EFR3A-208, Transcript of EFR3 homolog A, human

TSL 5 BASIC

Gene EFR3A, Length 2,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFR3A-208	ENST00000637848	PDE6C	P51160	858 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	GPC3	P51654	580 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	MFAP3	P55082	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	KRT76	Q01546	638 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	PRKCE	Q02156	737 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	KRT17	Q04695	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CETN1	Q12798	172 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	MPP2	Q14168	576 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	KYNU	Q16719	465 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	EVPL	Q92817	2033 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	BANF1	O75531	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CP	P00450	1065 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	GJB1	P08034	283 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	RALA	P11233	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	GZMA	P12544	262 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	IVD	P26440	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	MAPK4	P31152	587 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CHRNA3	P32297	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	JAK3	P52333	1124 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ITGA8	P53708	1063 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	RWDD2B	P57060	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ACTR2	P61160	394 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ORC1	Q13415	861 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	BIRC3	Q13489	604 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	KAZN	Q674X7	775 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ART4	Q93070	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFR3A-208	ENST00000637848	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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