RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 IRF2BP1Q8IU81 584 aa18.5■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 HLA-CQ95604 372 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 SLC35C1Q96A29 364 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 IRAK3Q9Y616 596 aa18.5■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 HLA-DRAP01903 254 aa18.49■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 TRIM59Q8IWR1 403 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 APPL2Q8NEU8 664 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 THAP9Q9H5L6 903 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 90.8
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CLN6-218ENST00000637223 SNX9Q9Y5X1 595 aa18.49■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 ZNF699Q32M78 642 aa18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 CBWD6Q4V339 395 aa18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.48■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.47■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 TYMPP19971 482 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 KLRC2P26717 231 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 ATICP31939 592 aa18.47■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 MYL5Q02045 173 aa18.47■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 CD320Q9NPF0 282 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 MTRRQ9UBK8 725 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 L1RE1Q9UN81 338 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 POLIQ9UNA4 740 aa18.47■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 H7C4K7 107 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 LINC01565O15544 149 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 LRRN2O75325 713 aa18.46■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 MYL7Q01449 175 aa18.46■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 ZNF280DQ6N043 979 aa18.46■□□□□ 0.55
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CLN6-218ENST00000637223 SEMA4DQ92854 862 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 MMS19Q96T76 1030 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 FANCLQ9NW38 375 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 FNIP2Q9P278 1114 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 DSEQ9UL01 958 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.46■□□□□ 0.55
CLN6-218ENST00000637223 KCNJ18B7U540 433 aa18.45■□□□□ 0.54
CLN6-218ENST00000637223 OAZ2O95190 189 aa18.45■□□□□ 0.54
CLN6-218ENST00000637223 AFPP02771 609 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CLN6-218ENST00000637223 CYP11A1P05108 521 aa18.45■□□□□ 0.54
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