RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617346.4

RPL17-222, Transcript of ribosomal protein L17, human

TSL 5

Gene RPL17, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL17-222	ENST00000617346	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ANK1	P16157	1881 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346		H7C4K7	107 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF263	O14978	683 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	CHAD	O15335	359 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ADRB2	P07550	413 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ATF6	P18850	670 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	PML	P29590	882 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	MCM4	P33991	863 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	CCR3	P51677	355 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	NEK4	P51957	841 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	PON2	Q15165	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	KIF2C	Q99661	725 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	LRP3	O75074	770 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	TOM1L1	O75674	476 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6	3e-6	■■■□□ 15.4
RPL17-222	ENST00000617346	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	CYP4F8	P98187	520 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	GPR17	Q13304	367 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	PDIA5	Q14554	519 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ST3GAL2	Q16842	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ASAH2	Q9NR71	780 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL17-222	ENST00000617346	TISP43	B9A030	160 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	CPB1	P15086	417 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	SDHB	P21912	280 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	GUCY2C	P25092	1073 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	HOXA6	P31267	233 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	NRL	P54845	237 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	WNT7B	P56706	349 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61	1e-10	■■■■■ 86.8
RPL17-222	ENST00000617346	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	HYI	Q5T013	277 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	IQCE	Q6IPM2	695 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	SCN1A	P35498	2009 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	AXIN1	O15169	862 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	PLS3	P13797	630 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	GABRR2	P28476	465 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL17-222	ENST00000617346	LILRA4	P59901	499 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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