RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRM6O15303 877 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HCRTO43612 131 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 URODP06132 367 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TPM3P06753 285 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 P4HA1P13674 534 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PON1P27169 355 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDH8P55286 799 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNMA1Q12791 1236 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ORC1Q13415 861 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WSCD1Q658N2 575 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS52Q8N1B4 723 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APPL2Q8NEU8 664 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SDCBP2Q9H190 292 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF576Q9H609 170 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOD2P04179 222 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WEE2P0C1S8 567 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJB1P25685 340 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASPAP45381 313 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLUD2P49448 558 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTP2Q5QGT7 225 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMC7Q7Z402 723 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METTL23Q86XA0 190 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEK11Q8NG66 645 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LMO3Q8TAP4 145 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAF4BQ92750 862 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCF25Q9BQ70 676 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLVAPQ9BX97 442 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNX25Q9H3E2 840 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SIX2Q9NPC8 291 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CARNS1A5YM72 827 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PMM2O15305 246 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARPP19P56211 112 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLCB3Q01970 1234 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CUL2Q13617 745 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP41Q3LFD5 358 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OSTM1Q86WC4 334 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTPALQ9BTX7 342 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TLR9Q9NR96 1032 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H3BNC9 293 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 M0QZQ0 153 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EPHB6O15197 1021 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RB1P06400 928 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDGFRBP09619 1106 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT5P13647 590 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRS1P35568 1242 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP8P40818 1118 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERVFC1P60507 584 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR1I3Q14994 352 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMD5Q16401 504 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UVSSAQ2YD98 709 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF394Q53GI3 561 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IQCEQ6IPM2 695 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBP1Q9H171 429 aa15.56■□□□□ 0.08
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GANQ9H2C0 597 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms