RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 NOTCH4Q99466 2003 aa9.72□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SHISA7A6NL88 538 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 ASAP2O43150 1006 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 KIF4AO95239 1232 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 NPTXRO95502 500 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 C8AP07357 584 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 RPS6KB1P23443 525 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CYP4A11Q02928 519 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CREMQ03060 361 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 GRIK3Q13003 919 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CAPSQ13938 189 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 XKR9Q5GH70 373 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 MTSS1LQ765P7 747 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 ING5Q8WYH8 240 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 POM121Q96HA1 1249 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 DYDC2Q96IM9 177 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 POLIQ9UNA4 740 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 F5P12259 2224 aa9.71□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SFI1A8K8P3 1242 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 FAM229AH3BQW9 127 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TADA2AO75478 443 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 NID1P14543 1247 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HOXA9P31269 272 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HSPA4P34932 840 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 EVCP57679 992 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CLDN10P78369 228 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 FZD5Q13467 585 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.863e-8■■□□□ 14.4
TTR-204ENST00000610404 EPHA7Q15375 998 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PSMD5Q16401 504 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 LIN9Q5TKA1 542 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CEP57Q86XR8 500 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CLDN23Q96B33 292 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 FAM20AQ96MK3 541 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TTPALQ9BTX7 342 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PARP2Q9UGN5 583 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 USP18Q9UMW8 372 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 VWA8A3KMH1 1905 aa9.7□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GUA9 196 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 PTGESO14684 152 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 CDC45O75419 566 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TDGF1P13385 188 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 GLRA2P23416 452 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 ARL2P36404 184 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 MAGEA9P43362 315 aa9.69□□□□□ -0.86
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TTR-204ENST00000610404 LMNB2Q03252 620 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 POU5F1BQ06416 359 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TUSC3Q13454 348 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 TFDP1Q14186 410 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 HACE1Q8IYU2 909 aa9.69□□□□□ -0.86
TTR-204ENST00000610404 BORCS6Q96GS4 357 aa9.69□□□□□ -0.86
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