RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592354.5

CAPNS1-213, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-213ENST00000592354 VIPR2P41587 438 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 KCNA1Q09470 495 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 TMC8Q8IU68 726 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SENP8Q96LD8 212 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 BCO2Q9BYV7 579 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 BRD9Q9H8M2 597 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 OBSL1O75147 1896 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 PPP1R37O75864 691 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 TYMPP19971 482 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 GDI1P31150 447 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 STAT6P42226 847 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 CASP5P51878 434 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 EPHA5P54756 1037 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 GPR17Q13304 367 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 PLD1Q13393 1074 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 CD302Q8IX05 232 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 LEMD2Q8NC56 503 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 DNASE1L2Q92874 299 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SMARCD2Q92925 531 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 USP28Q96RU2 1077 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MAFFQ9ULX9 164 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 DERAQ9Y315 318 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 A0A087X0B3 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ANO9A1A5B4 782 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 PIRO00625 290 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 LAMTOR5O43504 91 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MICAL2O94851 1124 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 GCNT3O95395 438 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 IDEP14735 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ADSSP30520 456 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ALDH1A3P47895 512 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 EPHB3P54753 998 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 WNT7BP56706 349 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MYBPC2Q14324 1141 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 CENPPQ6IPU0 288 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 HVCN1Q96D96 273 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SAAL1Q96ER3 474 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 FAM84AQ96KN4 292 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 LRRC3Q9BY71 257 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ASB7Q9H672 318 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 DPP3Q9NY33 737 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 MTMR6Q9Y217 621 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 C2CD2Q9Y426 696 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SHISA7A6NL88 538 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 CYP11A1P05108 521 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 GAP43P17677 238 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 PSMC3P17980 439 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 TAF6P49848 677 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 SV2BQ7L1I2 683 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 HINFPQ9BQA5 517 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 PANK2Q9BZ23 570 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-213ENST00000592354 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 CYB561D2O14569 222 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 ATF6P18850 670 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 WSCD1Q658N2 575 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 TSSK4Q6SA08 328 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 METTL23Q86XA0 190 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-213ENST00000592354 PDILTQ8N807 584 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms