RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 FYB2Q5VWT5 728 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF365Q70YC5 407 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 STK32CQ86UX6 486 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MPP5Q8N3R9 675 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC89Q8N998 374 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 OR56A3Q8NH54 315 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RUBCNQ92622 972 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SPSB4Q96A44 273 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 STK31Q9BXU1 1019 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SIK2Q9H0K1 926 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 GPR35Q9HC97 309 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PIP5K1BO14986 540 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNQ3O43525 872 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 UNC5CO95185 931 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 A1BGP04217 495 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 GRPP07492 148 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ITGA2BP08514 1039 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ITGB5P18084 799 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP5JP18859 108 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KRT9P35527 623 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC11A2P49281 568 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MRE11P49959 708 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TIGD6Q17RP2 521 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KRT40Q6A162 431 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 LIN54Q6MZP7 749 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TMTC2Q8N394 836 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ESX1Q8N693 406 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PDILTQ8N807 584 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 STYXQ8WUJ0 223 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 OR10A2Q9H208 303 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MID2Q9UJV3 735 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TMX2Q9Y320 296 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PEX10O60683 326 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RASSF9O75901 435 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJB5O75953 348 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 BAIAP3O94812 1187 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TNFRSF6BO95407 300 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CHEK2O96017 543 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SBK3P0C264 359 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ALAS1P13196 640 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ACVR2AP27037 513 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PHKA1P46020 1223 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 APBA1Q02410 837 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TLE2Q04725 743 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 VPS53Q5VIR6 699 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF605Q86T29 641 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC15A4Q8N697 577 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ASB12Q8WXK4 309 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CA14Q9ULX7 337 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.17□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A0B4J269 797 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 EXOC5O00471 708 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PJA2O43164 708 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms