RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 A0A1B0GTH6 734 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 SPTLC1O15269 473 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 TRAPPC3O43617 180 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 TADA2AO75478 443 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 FGF18O76093 207 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 CSPG5O95196 566 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 BRCC3P46736 316 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 LILRA4P59901 499 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 TNNC1P63316 161 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 COL19A1Q14993 1142 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 GBP6Q6ZN66 633 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 POF1BQ8WVV4 589 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 SEMA4DQ92854 862 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 SUSD3Q96L08 255 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 RAB20Q9NX57 234 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 STK39Q9UEW8 545 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-204ENST00000587769 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 KPNA7A9QM74 516 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 I3L4J1 428 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 TPM3P06753 285 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 ODC1P11926 461 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 P4HA1P13674 534 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 IRS1P35568 1242 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 LTBRP36941 435 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 PLCB3Q01970 1234 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 HYAL1Q12794 435 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 WDR44Q5JSH3 913 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 NT5C1BQ96P26 610 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 IGFLR1Q9H665 355 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.555e-14■■■■■ 211.5
CTIF-204ENST00000587769 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 C5orf42Q9H799 3197 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 M0QZQ0 153 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SYN3O14994 580 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 CBFA2T2O43439 604 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 NCK2O43639 380 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 LRRN2O75325 713 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 EFEMP2O95967 443 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SOD2P04179 222 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 UBASH3AP57075 661 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 UBXN1Q04323 297 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 KRT17Q04695 432 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 UBE3AQ05086 875 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SARM1Q6SZW1 724 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 LMO3Q8TAP4 145 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SENP8Q96LD8 212 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 CLDND1Q9NY35 253 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 IFNKQ9P0W0 207 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 DSEQ9UL01 958 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 POLIQ9UNA4 740 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 LZTS1Q9Y250 596 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 VWA8A3KMH1 1905 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 CYB561D2O14569 222 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 LINC01565O15544 149 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 HUS1O60921 280 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 URODP06132 367 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-204ENST00000587769 IL9P15248 144 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms