RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-223ENST00000584229 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.8■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 CDY1Q9Y6F8 540 aa26.8■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 LINC01565O15544 149 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 LILRB3O75022 631 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 VNN1O95497 513 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 FNIP2Q9P278 1114 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 MTRRQ9UBK8 725 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 DSEQ9UL01 958 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 FSD2A1L4K1 749 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 TYMPP19971 482 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 ATICP31939 592 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 GTF2H1P32780 548 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 MYL7Q01449 175 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 WDR72Q3MJ13 1102 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 WSCD1Q658N2 575 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 EFHBQ8N7U6 833 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 SLC35C1Q96A29 364 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 THAP9Q9H5L6 903 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 RXFP1Q9HBX9 757 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.882e-7■■□□□ 12.7
GPS1-223ENST00000584229 NCK2O43639 380 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 GLUD1P00367 558 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 CPB1P15086 417 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 OR1D2P34982 312 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 ZNF667Q5HYK9 610 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 GPR65Q8IYL9 337 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 L1RE1Q9UN81 338 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-223ENST00000584229 REV3LO60673 3130 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 EPCAMP16422 314 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CBWD6Q4V339 395 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 TOP6BLQ8N6T0 577 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 GDAP2Q9NXN4 497 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 POLIQ9UNA4 740 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 ADAM12O43184 909 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 SPATA31D3P0C874 917 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 FMO5P49326 533 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CLCN4P51793 760 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 MARSP56192 900 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 MYL5Q02045 173 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 FBXL13Q8NEE6 735 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CYP11A1P05108 521 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 P4HA1P13674 534 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 KCNH2Q12809 1159 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 VN1R2Q8NFZ6 395 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CASP10Q92851 521 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 HLA-CQ95604 372 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 KCNJ18B7U540 433 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 TGM5O43548 720 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 OAZ2O95190 189 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 STAU1O95793 577 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 GLP2RO95838 553 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 OR4Q2P0C623 313 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 KCNA5P22460 613 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 ROR1Q01973 937 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 CETN1Q12798 172 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 ADAM15Q13444 863 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GPS1-223ENST00000584229 KCNJ12Q14500 433 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms