RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 HTR3AP46098 478 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TM4SF4P48230 202 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GJA9P57773 515 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CAP1Q01518 475 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IL10RAQ13651 578 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NPNTQ6UXI9 565 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TTC7BQ86TV6 843 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DRC7Q8IY82 874 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GPR156Q8NFN8 814 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KAT5Q92993 513 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GJA10Q969M2 543 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RGMAQ96B86 450 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PANK3Q9H999 370 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DNAI1Q9UI46 699 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NUDCQ9Y266 331 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IRAK3Q9Y616 596 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CREB3O43889 395 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 AKR1B10O60218 316 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MGEA5O60502 916 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FSBPO95073 299 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MGAT2Q10469 447 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SSPNQ14714 243 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 LONRF1Q17RB8 773 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RNF220Q5VTB9 566 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SRLQ86TD4 932 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP53Q96M91 514 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 WDR92Q96MX6 357 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 L1RE1Q9UN81 338 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RPTORQ8N122 1335 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PR48 441 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SLC16A6O15403 523 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF4O60810 478 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 HMOX1P09601 288 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CD69Q07108 199 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PPP3CAQ08209 521 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 VWA3BQ502W6 1294 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRM-208ENST00000578600 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 IL17REQ8NFR9 667 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT11Q96G61 164 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ERO1AQ96HE7 468 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRM-208ENST00000578600 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SH3D21A4FU49 640 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP69A5D8W1 941 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PHF2O75151 1096 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM127O75204 238 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ENDOD1O94919 500 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRM-208ENST00000578600 CTSSP25774 331 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 PEX2P28328 305 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ETV4P43268 484 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MAP2K6P52564 334 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 SEMA5AQ13591 1074 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MCTP1Q6DN14 999 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 FAM84AQ96KN4 292 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-208ENST00000578600 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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