RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-212ENST00000567828 IQCEQ6IPM2 695 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-212ENST00000567828 HSCBQ8IWL3 235 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-212ENST00000567828 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-212ENST00000567828 FOXQ1Q9C009 403 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-212ENST00000567828 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.58■■□□□ 1.53
PPP4C-212ENST00000567828 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF197O14709 1029 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 IL18RAPO95256 599 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DCNP07585 359 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 MYL4P12829 197 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 WNT7BP56706 349 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DUSP4Q13115 394 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GPR17Q13304 367 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ASAH2Q9NR71 780 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FANCMQ8IYD8 2048 aa24.57■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 OBSL1O75147 1896 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 MTMR11A4FU01 709 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PPP6R2O75170 966 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ECI2O75521 394 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GJA1P17302 382 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FCARP24071 287 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 MYBPC2Q14324 1141 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ANGPT1Q15389 498 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 E2F4Q16254 413 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SIT1Q9Y3P8 196 aa24.56■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 MOSPD3O75425 235 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 YEATS4O95619 227 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CYP11A1P05108 521 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PAX3P23760 479 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TAF6P49848 677 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CDR1P51861 262 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 STARD6P59095 220 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ALCAMQ13740 583 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CENPPQ6IPU0 288 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PJA1Q8NG27 643 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.55■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CYB561D2O14569 222 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GFRA3O60609 400 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 CUTAO60888 179 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SOAT2O75908 522 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 MICAL2O94851 1124 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GARTP22102 1010 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 NBL1P41271 181 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 EPHA5P54756 1037 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PFKPQ01813 784 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PLD1Q13393 1074 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SLC44A4Q53GD3 710 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 HPS3Q969F9 1004 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ELSPBP1Q96BH3 223 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DHX58Q96C10 678 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SHDQ96IW2 340 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FAM84AQ96KN4 292 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ASB16Q96NS5 453 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TNMDQ9H2S6 317 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.54■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FAM186AA6NE01 2351 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 LRRN2O75325 713 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 EPHB3P54753 998 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 GRM2Q14416 872 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SHC4Q6S5L8 630 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 TMC8Q8IU68 726 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 LEMD2Q8NC56 503 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 DSEQ9UL01 958 aa24.53■■□□□ 1.52
PPP4C-212ENST00000567828 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms