RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM131Q92545 1883 aa3.13□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATMQ13315 3056 aa3.13□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYLKQ15746 1914 aa3.13□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.13□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYH11P35749 1972 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 KNTC1P50748 2209 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TSC2P49815 1807 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 A0A087WWV3 80 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 H0Y626 953 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC27A2O14975 620 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC37A4O43826 429 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM16O95361 564 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRAMEF12O95522 483 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 IGHDP01880 384 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CFIP05156 583 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 P4HBP07237 508 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 LIG1P18858 919 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GLRA2P23416 452 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CYP3A7P24462 503 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 YWHABP31946 246 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ADD1P35611 737 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTGER3P43115 390 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GALK1P51570 392 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDR1P51861 262 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 EPHA5P54756 1037 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CYP4A11Q02928 519 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 LMAN2Q12907 356 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PSMD2Q13200 908 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 SEMA3BQ13214 749 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 DSG2Q14126 1118 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 DMC1Q14565 340 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM132AQ24JP5 1023 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF423Q2M1K9 1284 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GPR158Q5T848 1215 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TTC22Q5TAA0 569 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TPGS2Q68CL5 300 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PMS2CLQ68D20 193 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GAREM2Q75VX8 874 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARMCX6Q7L4S7 300 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 SYT13Q7L8C5 426 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 HAUS6Q7Z4H7 955 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF605Q86T29 641 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TTC30AQ86WT1 665 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 FRMD1Q8N878 549 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 LEMD2Q8NC56 503 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 BICD2Q8TD16 824 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMC2Q8TDI7 906 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TBCKQ8TEA7 893 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 LXNQ9BS40 222 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRC3Q9BY71 257 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 DNAJC25Q9H1X3 360 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 EBF3Q9H4W6 596 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 GKN1Q9NS71 199 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 RGL1Q9NZL6 768 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 VAV3Q9UKW4 847 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPME1Q9Y570 386 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.12□□□□□ -1.91
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYH10P35580 1976 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms