RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	REST	Q13127	1097 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	PICALM	Q13492	652 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	CHST12	Q9NRB3	414 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	ABCF2	Q9UG63	623 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RBM23-208	ENST00000553876		A0A088AWK7	358 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	TYR	P14679	529 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	MAL	P21145	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CTXN1	P60606	82 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	RAB1A	P62820	205 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	HSD11B2	P80365	405 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GPSM2	P81274	684 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GUCY1B3	Q02153	619 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	FGL2	Q14314	439 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	BRD3	Q15059	726 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	IL31	Q6EBC2	164 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CFAP69	A5D8W1	941 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GOLIM4	O00461	696 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PMM2	O15305	246 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CDKL5	O76039	1030 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	FCER1A	P12319	257 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	TYRP1	P17643	537 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	NEK3	P51956	506 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CXADR	P78310	365 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CREM	Q03060	361 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PLS1	Q14651	629 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PIPSL	A2A3N6	862 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GRM6	O15303	877 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	MGEA5	O60502	916 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	HAUS5	O94927	633 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GC	P02774	474 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	CD1A	P06126	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	ALAS1	P13196	640 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PEX2	P28328	305 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	INHBE	P58166	350 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	BIRC2	Q13490	618 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	GPR149	Q86SP6	731 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PMM1	Q92871	262 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	RNF31	Q96EP0	1072 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	STAP2	Q9UGK3	403 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	OVOL3	O00110	214 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	F2RL2	O00254	374 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RBM23-208	ENST00000553876	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58

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