RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.74■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 INTS13Q9NVM9 706 aa21.74■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.74■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 TNNC2P02585 160 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 KRT19P08727 400 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 MYBPC2Q14324 1141 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 FNBP1Q96RU3 617 aa21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 EXOC3O60645 756 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 RBP5P82980 135 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 ZXDAP98168 799 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 ADCY1Q08828 1119 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 KCNB1Q14721 858 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 SCN1AP35498 2009 aa21.72■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 TSC2P49815 1807 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 PDXKO00764 312 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 TNNI1P19237 187 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 FSHRP23945 695 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 CYP24A1Q07973 514 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 GPR17Q13304 367 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 MTMR3Q13615 1198 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 PSMD6Q15008 389 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 BORCS6Q96GS4 357 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.71■■□□□ 1.07
TPCN1-212ENST00000549279 PRR33A8MZF0 331 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SEC24AO95486 1093 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 OR4Q2P0C623 313 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 BFSP1Q12934 665 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 MYO1EQ12965 1108 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 ELMOD1Q8N336 334 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 CGRRF1Q99675 332 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 HUS1O60921 280 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 PTPN2P17706 415 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 NTHL1P78549 312 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 WSCD1Q658N2 575 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 CXorf38Q8TB03 319 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 MYADMQ96S97 322 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 RMND1Q9NWS8 449 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SIX4Q9UIU6 781 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 PTPRJQ12913 1337 aa21.69■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 ASGR2P07307 311 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 PLD1Q13393 1074 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 IQCEQ6IPM2 695 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 FAM84AQ96KN4 292 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TIGD1Q96MW7 591 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 DMAC2Q9NW81 257 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 MTMR11A4FU01 709 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 NR3C1P04150 777 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 LAMP2P13473 410 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TWF1Q12792 350 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SMARCB1Q12824 385 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 PNOCQ13519 176 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 SPATA18Q8TC71 538 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 NXPE3Q969Y0 559 aa21.67■■□□□ 1.06
TPCN1-212ENST00000549279 HPDLQ96IR7 371 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms