RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PDXDC1Q6P996 788 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 WDCPQ9H6R7 721 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 RAB23Q9ULC3 237 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DISP2A7MBM2 1401 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ARP10275 920 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 VCLP18206 1134 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PHKG1Q16816 387 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CES5AQ6NT32 575 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MIB1Q86YT6 1006 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SNF8Q96H20 258 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087WZ62 844 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 OPHN1O60890 802 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PYGLP06737 847 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MAP3K7CLP57077 242 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ADCY2Q08462 1091 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ORC1Q13415 861 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC78A2IDD5 438 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CTNNB1P35222 781 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DDR1Q08345 913 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SHC4Q6S5L8 630 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CIPCQ9C0C6 399 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MAPK13O15264 365 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 LHX1P48742 406 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 EFEMP1Q12805 493 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC38Q502W7 563 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MYMKA6NI61 221 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC188H7C350 402 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FOXN1O15353 648 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 HOXC6P09630 235 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 RPA1P27694 616 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 HMOX2P30519 316 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 RAP1GAPP47736 663 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ARSEP51690 589 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 WHAMMQ8TF30 809 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SNTG2Q9NY99 539 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 PCDH8O95206 1070 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FGFR4P22455 802 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 IPMKQ8NFU5 416 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINI1Q99574 410 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 STK33Q9BYT3 514 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FAM50BQ9Y247 325 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 NCK2O43639 380 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 GFAPP14136 432 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SEMA3FQ13275 785 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC7Q99615 494 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SENP2Q9HC62 589 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 MAPK9P45984 424 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-204ENST00000538708 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms