RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259		K7ENM7	598 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PODXL	O00592	558 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ECI2	O75521	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GCNT3	O95395	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEC24A	O95486	1093 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MCF2	P10911	925 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ATF2	P15336	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PTPN2	P17706	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF131	P52739	623 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	STRN3	Q13033	797 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259		H0YCG3	227 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYN3	O14994	580 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CEBPB	P17676	345 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FCAR	P24071	287 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCR2	P41597	374 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PFKP	Q01813	784 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	STK4	Q13043	487 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNB1	Q14721	858 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SUSD3	Q96L08	255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MOSPD3	O75425	235 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MICAL2	O94851	1124 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ELF1	P32519	619 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NELL1	Q92832	810 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BICD1	Q96G01	975 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CORO1B	Q9BR76	489 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259		H7C4K7	107 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PRRG1	O14668	218 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TOM1L1	O75674	476 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	VNN2	O95498	520 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LRG1	P02750	347 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CASP5	P51878	434 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARPP19	P56211	112 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GTF2B	Q00403	316 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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