RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	UNC5C	O95185	931 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	GJB1	P08034	283 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	IL1R1	P14778	569 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	BMP7	P18075	431 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	SERPINF1	P36955	418 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	EPHB3	P54753	998 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	ARL4C	P56559	192 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	BPIFB4	P59827	614 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	APBA1	Q02410	837 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	KIF22	Q14807	665 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	TAF12	Q16514	161 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	SLC15A4	Q8N697	577 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	VPS45	Q9NRW7	570 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MED17-208	ENST00000531920	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SYT5	O00445	386 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	MTSS1	O43312	755 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RASSF9	O75901	435 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SASH1	O94885	1247 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RHOBTB3	O94955	611 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	FAM163B	P0C2L3	166 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ATP5J	P18859	108 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	MAN1A1	P33908	653 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	UCP3	P55916	312 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	DLG4	P78352	724 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	NFIX	Q14938	502 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RAB30	Q15771	203 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	GDF15	Q99988	308 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	MRI1	Q9BV20	369 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920		J3KRW8	73 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	EYA2	O00167	538 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RFXAP	O00287	272 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	AREL1	O15033	823 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	IRAK2	O43187	625 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	DNAJB5	O75953	348 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	GNAI2	P04899	355 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	GRP	P07492	148 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RARB	P10826	455 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ZNF28	P17035	718 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	CNTF	P26441	200 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SLC6A4	P31645	630 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	DDIT3	P35638	169 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SLC11A2	P49281	568 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	PTK2B	Q14289	1009 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	NAXE	Q8NCW5	288 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	RUBCN	Q92622	972 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MED17-208	ENST00000531920	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		5.26	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms