RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 METTL23Q86XA0 190 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 TRANK1O15050 2925 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 H7C4K7 107 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 CYB561D2O14569 222 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 MIIPQ5JXC2 388 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRK-218ENST00000525459 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PTPN14Q15678 1187 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF280DQ6N043 979 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CEP57Q86XR8 500 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 GCNT4Q9P109 453 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 I3L4J1 428 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJB1P25685 340 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CAMK1Q14012 370 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 RTP2Q5QGT7 225 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 GBP6Q6ZN66 633 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TTC39CQ8N584 583 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB123Q8N688 67 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 FAM81BQ96LP2 452 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 FNIP2Q9P278 1114 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TACC1O75410 805 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 OAZ2O95190 189 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ERVFC1P60507 584 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PSMD5Q16401 504 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 MMS19Q96T76 1030 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 C1RP00736 705 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 LHX1P48742 406 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 NT5C1BQ96P26 610 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 MTRRQ9UBK8 725 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 L1RE1Q9UN81 338 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PLXNA3P51805 1871 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 LGALS16A8MUM7 142 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 RFXAPO00287 272 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CXCL14O95715 111 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ATP1A3P13637 1013 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFV1P49821 464 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 SEMA4DQ92854 862 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 FAM161BQ96MY7 647 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 BCO2Q9BYV7 579 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 VPS16Q9H269 839 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 OR6C75A6NL08 312 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 LILRB3O75022 631 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ADH1AP07327 375 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CA8P35219 290 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 C2CD2LO14523 706 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINC1P01008 464 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 RFX1P22670 979 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 PCSK1P29120 753 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 ASPAP45381 313 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 GCNT1Q02742 428 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-218ENST00000525459 WSCD1Q658N2 575 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms